TGD Home Tetrahymena Genome Database


Quick Search:

Genome Resources
Genome Browser
BLAST & BLAT
Textpresso
(Full-Text Search)
Tetrahymena
Literature
Tetrahymena
Biology
Community
Information
Stock Center at Cornell
Tutorial
Help
About TGD
Home

AS - GM  RAPD DNA polymorphisms  - Alphabetical list

 

Click here for the key to the list of RAPD loci and abbreviations used.

 

 

======

=======

==

=========

=======

=====

=============

============

Locus

Primers

Mg

Size (Kb)

Same 

Other

Linkage    

Coassortment

name

     

mM

       

 as? 

notes

group (MIC) 

group (MAC)

======

=======

==

=========

=======

=====

=============

============

1AS02 

A12 C05

 

1.0     

     

   

lg1L-mat    

     MiLtd 

1AS02R

A12 C05

 

1.4     

     

   

lg5X-JB04   

Cag5X-RK04a 

1AT01 

B20 C01

 

0.9     

     

psMiL

lg1R-GAL1   

cag1R-AT01 (+) 

1AT01R

B20 C01

 

0.6     

     

   

lg1R-GAL1   

cag1R-ATO1R 

1AT03/R

B20 C05

 

0.55/0.42

     

   

lg1L-mat    

cag1L-AT03  

1AT04 

B07 C04

 

0.5     

     

   

lg2R-MPR1   

cag2R-AT04  

1AT04R

B07 C04

 

0.55    

     

   

lg4R-LC01   

cag4R-AT04R (+)

1AT06 

B19 C08

 

1.5     

     

   

lg5X-JB04   

     MiLtd 

1AT11 

B07 C17

 

1.2     

     

   

lg4L-BR19   

cag4L-LK04  

1AT17 

B05 C19

 

0.4     

     

   

lg4R-LC01   

cag4R-AT17  

1AT18 

B08 C02

 

0.75    

     

   

lg4L-QD02R  

cag4L-AT18  

1BB01 

E10 E12

 

1.8     

1YD20 

   

lg4L-AS01   

cag4L-YD20  

1BB01R

E10 E12

 

1.05    

1YD20R

   

lg1L-mat    

     MiLtd 

1BD03 

F01 F08

 

1.1     

     

   

lg1R-BD03   (UL)

cag1R-BD03  

1BD06 

F01 F20

 

0.4     

     

   

lg1L-mat    

cag1L-BD06 (-)

1BD08R

F02 F11

 

0.4     

     

   

lg1L-mat    

     MiLtd 

1BD10 

F03 F12

 

1.2     

     

   

lg4R-LC01   

cag4R-LC26  

1BD11 

F03 F16

 

0.33    

     

   

lg1L-mat    

cag1L-XS36  

1BD13 

F04 F11

 

0.8     

     

   

lg3R-JO06   

cag3R-LC21R 

1BD16 

F06 F18